Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins3Q9CY94 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms