Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc3Q9CXE6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Xrcc3Q9CXE6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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