Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mgme1Q9CXC3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms