Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnbl1Q9CWL8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms