Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms