Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms