Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifitm3Q9CQW9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifitm3Q9CQW9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms