Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rwdd1Q9CQK7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rwdd1Q9CQK7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms