Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asf1aQ9CQE6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms