Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nipsnap3bQ9CQE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms