Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab5aQ9CQD1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab5aQ9CQD1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms