Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms