Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NenfQ9CQ45 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NenfQ9CQ45 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms