Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms