Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg5Q99PE8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms