Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b1Q99NB9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b1Q99NB9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms