Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brms1Q99N20 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms