Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PccbQ99MN9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms