Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncaipQ99ME3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SncaipQ99ME3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SncaipQ99ME3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms