Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RtcbQ99LF4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RtcbQ99LF4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms