Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp11Q99K46 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp11Q99K46 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms