Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufsp2Q99K23 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufsp2Q99K23 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms