Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdelr1Q99JH8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelr1Q99JH8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms