Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smim11aQ99J19 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms