Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctu1Q99J10 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctu1Q99J10 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms