Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms