Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Trpm2Q91YD4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trpm2Q91YD4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trpm2Q91YD4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms