Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Basp1Q91XV3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Basp1Q91XV3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Basp1Q91XV3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Basp1Q91XV3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Basp1Q91XV3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Basp1Q91XV3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Basp1Q91XV3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms