Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trub2Q91WG3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms