Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klc3Q91W40 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klc3Q91W40 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms