Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp3Q91W36 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp3Q91W36 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp3Q91W36 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp3Q91W36 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp3Q91W36 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp3Q91W36 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms