Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pth2Q91W27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms