Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col26a1Q91VF6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms