Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc115Q8VE99 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms