Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh10Q8VCH7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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