Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dnajc28Q8VCE1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnajc28Q8VCE1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms