Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Hecw1Q8K4P8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Hecw1Q8K4P8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms