Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pof1bQ8K4L4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pof1bQ8K4L4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms