Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms