Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fcho1Q8K285 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Fcho1Q8K285 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms