Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf3Q8K268 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf3Q8K268 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf3Q8K268 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcf3Q8K268 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Abcf3Q8K268 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Abcf3Q8K268 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Abcf3Q8K268 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcf3Q8K268 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcf3Q8K268 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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