Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf628Q8CJ78 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf628Q8CJ78 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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