Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf17Q8CFA7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms