Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CF25 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8CF25 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8CF25 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CF25 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8CF25 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8CF25 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8CF25 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8CF25 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8CF25 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8CF25 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CF25 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CF25 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF25 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF25 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF25 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF25 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF25 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF25 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CF25 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF25 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF25 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF25 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CF25 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms