Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp27Q8CEG8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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