Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atad2Q8CDM1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atad2Q8CDM1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 531.8 ms