Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc87Q8CDL9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms