Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI6

Ccdc158, Coiled-coil domain-containing protein 158, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc158Q8CDI6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc158Q8CDI6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc158Q8CDI6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc158Q8CDI6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc158Q8CDI6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc158Q8CDI6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc158Q8CDI6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc158Q8CDI6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc158Q8CDI6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms