Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms