Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn3Q8CBC6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms